改制后的上會會計師事務所（特殊普通合伙）實行主任會計師（首席合伙人）負責制、副主任會計師（管理合伙人）分管各部門及各分所的工作。重大事項由合伙人管理委員會報合伙人大會決策，重大和特殊業務的質量控制標準由專業技術委員會制定。 目前事務所設立有質量控制部（下轄專業技術委員會）、稅務服務部、咨詢部、行政等部門，在全國設立有多家分支機構。 組織架構圖如下：
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